El Museo Diocesano de Arte Sacro cuenta en la actualidad con una colección de más de 2.000 piezas, de las que cerca de 500 están en exposición. Estas cifras están en progresivo aumento gracias a nuevas donaciones y depósitos. Prácticamente todas estas obras son de carácter artístico, abarcando desde el siglo XII hasta el XX, aunque hay también algunos materiales de carácter arqueológico que se remontan hasta el siglo III.

La exposición permanente se organiza en tres grandes apartados: escultura-pintura, orfebrería y ornamentos (vestiduras). En cada uno de estos bloques se ordenan las piezas siguiendo un criterio cronológico-estilístico.

La calidad de estas obras es más que destacable. Por ejemplo, la sala de orfebrería reúne uno de los mejores conjuntos de Europa. En otra estancia pueden contemplarse trece alabastros góticos ingleses, la serie más numerosa expuesta en toda España. Más allá quince cuadros sobre la vida de Cristo salidos del taller del napolitano Lucas Jordán, uno de los más importantes pintores del barroco. A su lado un clave debido al lutier barcelonés Salvador Bofill ha atraído hasta el Museo a músicos de todo el mundo. Tras contemplar trabajos de Beaugrant, Mignard, La Roldana, Carmona, Carnicero o Paret –bien representados en El Prado, el Louvre, la National Gallery…–, en la sala dedicada al arte religioso contemporáneo encontramos piezas de importantes firmas del arte del siglo XX, como Quintín de Torre, Asorey, Basiano, López Villaseñor, Larrea...